Флуоресцентный анализ позволяет проводить детекцию результатов амплификации продуктов ПЦР, не открывая пробирки (используя реагенты серии FEP).
В основе метода лежит принцип гибридизации флуоресцентно-меченого олигонуклеотидного зонда с комплементарным участком амплифицируемой ДНК-мишени, в результате которой происходит нарастание интенсивности флуоресценции. Присутствие такого зонда в реакционной смеси позволяет регистрировать накопление продуктов амплификации путем измерения интенсивности флуоресцентного сигнала.
Таким образом, решается одна из основных проблем лаборатории – опасность контаминации ампликонами, а также сводится к минимуму субъективизм при интерпретации результатов благодаря автоматическому учету данных.